对于第一代测序仪器;国内外主流的测序仪器主要有以下几种:第一代测序仪器:ABI的3730XL型号测序仪器、测序仪器,其原理为桑格法-0。IonProton 测序仪器由iontorrentABI固测序仪器(国内不再供货);罗氏的454 测序仪器(2013年底停产);第三代测序仪器:CG公司CG 测序系统(2013年被BGI收购,有人认为CG不属于第三代测序仪器);太平洋生物公司的pacbiosii测序仪器等。
BGISeq500(内部开发代号斑马)名字很隐晦,看起来直接竞争对手是illumina的NextSeq500。之前有两个国产测序仪器,中科馨子比吉斯和华银康PSTARII。在这个帖子里,我觉得不应该把他们拿出来给老东家嘲讽恶心。主要参数:通量:BGISeq500:8200G,NextSeq500,25G120G读数长度:BGI SEQ 500:50SE/50PE/100SE/100PE,NextSeq500,75SE/75PE/150PE质量:BGI SEQ 500: Q 30Bases > 80。NextSeq500,Q30bases>75%/80%(嘿嘿)运行时间:BGISeq500:24h,NextSeq500,1230h,可以说两个500公司都是全方位正。
1977年,英国化学家FrederickSanger发明了双脱氧链终止法。这项技术和W.Gilbert发明的化学降解法被称为第一代测序技术。Sanger方法测序使用DNA聚合酶来延伸与未确定序列的模板结合的引物。直到掺入链终止核苷酸。每个测序由一组四个独立的反应组成,每个反应包含所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并与有限量的不同双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)混合。
终点取决于反应中相应的双脱氧。每个dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调节,从而可以得到一组几百到几千个碱基的链终止产物。它们有相同的起点,但终止于不同的核苷酸。用高分辨率变性凝胶电泳可分离出大小不同的片段,经凝胶处理后,用x光胶片放射自显影或非同位素标记法检测。
3、第三代基因 测序服务提供商有哪些做得好的机构,国内我司使用天津湖滨盘古基因科学发展有限公司,多次合作,主要服务于高校。没见过什么大广告,但在业内口碑不错。测序仪器在市场上使用,到第三代测序仪器。第一个测序实验是桑格在20世纪60年代进行的,1976年第一个商用测序仪器正式出现。对于第一代测序仪器;国内外主流的测序仪器主要有以下几种:第一代测序仪器:ABI的3730XL型号测序仪器、测序仪器,其原理为桑格法-0。
IonProton 测序仪器由iontorrentABI固测序仪器(国内不再供货);罗氏的454 测序仪器(2013年底停产);第三代测序仪器:CG公司CG 测序系统(2013年被BGI收购,有人认为CG不属于第三代测序仪器);太平洋生物公司的pacbiosii测序仪器等。
4、为什么DNA 测序需要剪成小段呢是因为只能DNA测序interruption的范围一般在200300bp左右,由测序读取的片段长度决定。目前illumina的测序仪器中Miseq系列的读数长度为2x300bp,nextseq的读数长度为2x150bp。每个系列的阅读长度可以在illumina官网自行查看。如果你指的是建立数据库时需要被拆分成特定长度的片段的二代DNA 测序的话,那是因为不同仪器的测序的读取长度不同。
比如Illumina platform,DNA插入片段的长度一般在400500bp左右。如果需要测试,这个片段的长度要进一步缩短到阅读长度;如果是454 测序,插入片段的长度一般可以达到1Kb以上。对于Illumina平台,有单端测序和双端测序两种,具体在测序的过程中。
5、 测序原理:一代二代三代 测序原理详解双脱氧链终止法采用了DNA复制的原理。Sanger 测序反应体系包括靶DNA片段、脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)、双脱氧核苷酸三磷酸(ddNTP)、测序引物和DNA聚合酶。测序反应的核心是它所使用的ddNTP:由于缺少3’OH基团,它不具备与另一个dNTP形成磷酸二酯键的能力,这些ddNTP可以用来终止DNA链的延伸。此外,这些ddNTP与放射性同位素或荧光标记基团相连,因此它们可以被自动化仪器或凝胶成像系统检测到。
6、IlluminaHiseq/Miseq 测序原理简介1,Solexa 测序 Technology前世索莱克斯高通量测序 Technology由英国剑桥大学的子公司索莱克斯公司成立。该方法基于单分子阵列技术,是synthesis 测序技术的发展和延伸,二、测序 Principle Solexa是基于边缘综合测序技术的一种新的测序技术。桥接PCR反应通过单个分子阵列在小流通池上实现。